微生物菌種資源是重要的戰(zhàn)略資源，與人類健康和生態(tài)安全息息相關(guān)。深度發(fā)掘、共享和利用微生物資源對生命科學(xué)研究和生物產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新具有重要意義。目前普遍認(rèn)為僅有1%-5%的微生物被分離鑒定，部分學(xué)者甚至認(rèn)為已知的微生物僅占十萬分之一（Locey& Lennon，2016），絕大多數(shù)微生物仍未被發(fā)現(xiàn)和分離鑒定。新物種蘊(yùn)含著新的遺傳資源及生理代謝機(jī)制，并具有巨大的開發(fā)應(yīng)用潛力，因此探索和發(fā)掘微生物新物種仍是當(dāng)今微生物學(xué)領(lǐng)域重要的科學(xué)任務(wù)。
微生物的系統(tǒng)分類是建立以界、門、綱、目、科、屬、種為不同階元等級的鑒別體系，反映微生物的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系，“種”（Species）是該體系最基本的分類單位。模式菌株（Type strain）是在首次正式描述和命名微生物物種時所使用的、活的純培養(yǎng)物，是作為分類的實(shí)物依據(jù)和準(zhǔn)則。根據(jù)國際原核生物命名法（International Code of Nomenclature of Prokaryotes，ICNP)，所有新命名的可培養(yǎng)微生物，都必須指定一個模式菌株，并作為公共資源，同時保存到2個國家和/或地區(qū)的菌種保藏中心。
模式菌株通常是同一微生物物種中生物學(xué)特征描述最清晰的菌株，具有唯一性和參考性，是一類特殊的微生物資源。根據(jù)LPSN（List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature）（Parte，2018）官方網(wǎng)站統(tǒng)計，截至2020年6月，依照國際原核生物命名法有效發(fā)表的微生物共19527種（https://lpsn.dsmz.de/text/numbers），這些已知物種的模式菌株廣泛分布在全球各公共菌種保藏中心，其中比較重要和著名的菌種保藏中心包括德國微生物菌種保藏中心（German Collection of Microorganisms and Cell Cultures，DSMZ）、日本微生物菌種保藏中心（Japan Collection of Microorganisms，JCM）和美國典型菌種保藏中心（American Type Culture Collection，ATCC）等。國家微生物資源平臺數(shù)據(jù)顯示，目前我國共有模式菌株3673株（http://nimr.org.cn/moshijunIndexAction.action），主要集中在中國普通微生物菌種保藏管理中心（China General Microbiological Culture Collection Center，CGMCC）和中國典型培養(yǎng)物保藏中心（China Center for Type Culture Collection，CCTCC）。廣東省微生物菌種保藏中心（GuangDong Microbial Culture Collection Center，GDMCC）和其他專業(yè)菌種保藏中心亦有一定數(shù)量的保存。
中國學(xué)者對微生物分類學(xué)發(fā)展貢獻(xiàn)巨大。自2011年起，中國成為世界上每年發(fā)表微生物新種最多的國家（Sant'Annaet al., 2020）。隨著微生物分離與培養(yǎng)新方法、新技術(shù)的不斷出現(xiàn)，越來越多的微生物新資源將被發(fā)現(xiàn)，意味著需要更多數(shù)量的模式菌株用于對比實(shí)驗(yàn)研究。中國學(xué)者從國外保藏機(jī)構(gòu)獲取模式菌株，要受到《生物多樣性公約》、《名古屋議定書》、當(dāng)事國生物遺傳資源管理法規(guī)、菌種保藏中心材料轉(zhuǎn)移協(xié)議（MTA）以及國際貿(mào)易和運(yùn)輸條件等諸多因素的約束，需要耗費(fèi)研究者大量的時間和精力，甚至有些菌株難以從國際保藏機(jī)構(gòu)獲取，嚴(yán)重影響了我國微生物分類學(xué)研究工作的開展。
為了提高模式菌株的可獲得性，進(jìn)一步促進(jìn)模式菌株的長期安全保藏和開放共享，廣東省微生物研究所和廣東微生物菌種保藏中心擬聯(lián)合國內(nèi)外微生物資源同行發(fā)起共建全球模式菌株庫（Global Type Strain Bank，GTSB）行動，致力于：（1）通過合法途徑實(shí)現(xiàn)散在模式菌株資源的整合；（2）搭建大規(guī)模、高質(zhì)量的模式菌株實(shí)物庫；（3）開發(fā)模式菌株全分類指標(biāo)標(biāo)準(zhǔn)信息庫；（4）模式菌株實(shí)物和信息的公益共享。通過GTSB行動，提升模式菌株的可獲得性，促進(jìn)我國微生物分類學(xué)研究的發(fā)展。
廣東省微生物菌種保藏中心（WDCM編號953）成立于1987年，是國際認(rèn)可的模式菌株保藏機(jī)構(gòu)和《布達(dá)佩斯條約》國際保藏單位（International Depositary Authority，IDA），現(xiàn)已建成擁有普通微生物菌種庫、專利菌種庫和13個專業(yè)菌種庫的大型微生物資源中心，保藏菌種23000多株，覆蓋了農(nóng)業(yè)、工業(yè)、環(huán)境、分析和食藥用菌等領(lǐng)域，并具有顯著的熱帶亞熱帶特色，長期為社會各界提供高效的菌種資源共享和鑒定等服務(wù)，菌株發(fā)放率處于國內(nèi)前列。中心現(xiàn)有工作人員63名，保藏庫面積約2000平米。近年來，中心積極開展模式菌株的收集、整理、保藏和共享工作，現(xiàn)存各類模式菌株1089株。中心愿借本次公益行動，繼續(xù)做好微生物資源的保藏與共享服務(wù)工作，將為全球模式菌株庫（GTSB）提供專門的資源保藏空間和設(shè)施（保藏庫面積約1000平米），使用3種以上的方式進(jìn)行資源的長期安全保藏。
廣東省微生物菌種保藏中心將在《生物多樣性公約》和《名古屋議定書》框架下，積極與模式菌株的原始保藏人和相關(guān)保藏機(jī)構(gòu)聯(lián)系，在嚴(yán)格遵守相關(guān)法律法規(guī)和充分尊重知識產(chǎn)權(quán)的基礎(chǔ)上，實(shí)現(xiàn)更多的模式菌株資源的整合與公益性共享。歡迎國內(nèi)學(xué)者將待發(fā)表模式菌株保存在我中心，中心將提供免費(fèi)全基因組草圖測序服務(wù)，同時也將按保藏菌株數(shù)量的2倍為保藏人免費(fèi)提供庫藏的其它模式菌株。
讓我們共同攜手，建設(shè)全球模式菌株庫，更好地服務(wù)中國微生物資源學(xué)研究。
真誠期待您的參與！
本倡議得到了鄧子新院士、吳清平院士、張偲院士、沈建忠院士、陳堅院士、陳衛(wèi)院士、任發(fā)政院士、楊瑞馥研究員、東秀珠研究員、姜瑞波研究員和程池教授的大力支持！
有意參加共建的單位和專家可以發(fā)郵件至 gtsb@gdim.cn，或電話聯(lián)系鄧名榮（13760724481）、馮廣達(dá)（13760649653）。
廣東省微生物研究所 廣東省微生物菌種保藏中心
2020年6月26日
全球模式菌株庫（GTSB）共建行動指導(dǎo)專家委員會
鄧子新院士 吳清平院士 張偲院士 沈建忠院士 陳堅院士陳衛(wèi)院士 任發(fā)政院士 楊瑞馥研究員 東秀珠研究員 姜瑞波研究員 程池教授
全球模式菌株庫（GTSB）共建行動監(jiān)督專家委員會
主任：吳清平院士
副主任：朱紅惠 邵宗澤 李文均 許學(xué)偉
委員（按姓氏首字母排序）：
曹 毅 陳 波 陳冠軍 承 磊 崔恒林 杜宗軍 鄧 宇
郭文超 何 健 何 山 李 猛 李越中 劉 波 全哲學(xué)
田新朋 萬 一 王 韌 王 瑋 王治業(yè) 韋革宏 吳 敏
楊 紅 姚 粟 姚 青 張惠文 張利莉 張 維 張曉華
鄭世學(xué) 周劍平
秘書：鄧名榮 馮廣達(dá)
目前，已有來自以下單位的專家支持并愿意參與全球模式菌株庫（GTSB）共建行動：
（按單位名稱首字母排序）
北京市農(nóng)林科學(xué)院
大連民族大學(xué)
東北農(nóng)業(yè)大學(xué)
復(fù)旦大學(xué)
福建農(nóng)林大學(xué)
福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院
暨南大學(xué)
江南大學(xué)
江蘇大學(xué)
軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院
甘肅省科學(xué)院生物研究所
廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所
海南大學(xué)
河海大學(xué)
華南理工大學(xué)
華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
華中師范大學(xué)
湖南大學(xué)
南開大學(xué)
南京農(nóng)業(yè)大學(xué)
南京工業(yè)大學(xué)
內(nèi)蒙古大學(xué)
寧波大學(xué)
農(nóng)業(yè)農(nóng)村部沼氣科學(xué)研究所
山東大學(xué)（青島）
山東大學(xué)（威海）
上海交通大學(xué)
陜西省科學(xué)院陜西省微生物研究所
深圳大學(xué)
深圳國家基因庫
四川大學(xué)
塔里木大學(xué)
西北農(nóng)林科技大學(xué)
西藏農(nóng)牧學(xué)院
廈門大學(xué)
新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院微生物應(yīng)用研究所
新疆師范大學(xué)
云南大學(xué)云南省微生物研究所
浙江大學(xué)
浙江農(nóng)林大學(xué)
浙江理工大學(xué)
中山大學(xué)
中國海洋大學(xué)
中國工業(yè)菌種保藏管理中心
中國海洋微生物菌種保藏管理中心
中國極地研究中心
中國科學(xué)院南海海洋研究所
中國科學(xué)院沈陽應(yīng)用生態(tài)研究所
中國科學(xué)院煙臺海岸帶研究所
中國農(nóng)業(yè)大學(xué)
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所
中國食品發(fā)酵工業(yè)研究院
自然資源部第二海洋研究所
自然資源部第三海洋研究所
參考文獻(xiàn)
1. Locey, K.J. & Lennon, J.T. Scaling laws predict global microbial diversity. Proc Natl Acad Sci USA. 2016. 113(21):5970-5975.
2. Sant'Anna FH, Reiter KC, Fátima Almeida P, Pereira Passaglia LM. Systematic review of descriptions of novel bacterial species: evaluation of the twenty-first century taxonomy through text mining. Int J Syst Evol Microbiol. 2020. 70(4):2925-2936.
3. Parte, AC. LPSN — List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (bacterio.net), 20 years on. Int J Syst Evol Microbiol. 2018. 68(6):1825-1829.
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廣東省微生物研究所 廣東省微生物菌種保藏中心發(fā)起共建全球模式菌株庫GTSB的倡議書 |