廣東省微生物研究所菌種保藏中心（GIMCC），專業(yè)的菌種保藏中心，有二十年多年的菌種分類鑒定歷史，擁有先進(jìn)的生物科學(xué)儀器和從事分類鑒定的專業(yè)化人員隊伍。GIMCC承擔(dān)全國微生物菌種的委托鑒定工作，為國內(nèi)科研機(jī)構(gòu)、大專院校和生產(chǎn)企業(yè)等提供微生物菌種的鑒定及微生物菌劑環(huán)境安全評價服務(wù)，保證在鑒定和評價程序內(nèi)使用所提供菌種，不私自提取、保藏、轉(zhuǎn)讓或作他用。
菌種鑒定手段包括：
（1）常規(guī)鑒定
常規(guī)鑒定的內(nèi)容有形態(tài)特征和理化特性。形態(tài)特征包括顯微形態(tài)和培養(yǎng)特征；理化特性包括營養(yǎng)類型、碳氮源的利用能力、各種代謝反應(yīng)、酶反應(yīng)等；新種等可做細(xì)胞壁化學(xué)組分、肽聚糖種類，脂肪酸含量， DNA-DNA雜交、G+C摩爾百分比等。
（2）BioLog碳源自動分析鑒定
BioLog鑒定系統(tǒng)以微生物對不同碳源的利用情況為基礎(chǔ)，檢測微生物的特征指紋圖譜，建立與微生物種類相對應(yīng)的數(shù)據(jù)庫。通過軟件將待測微生物與數(shù)據(jù)庫參比，得出鑒定結(jié)果。該系統(tǒng)已獲美國FDA認(rèn)可，已逐步應(yīng)用于食品和飲品企業(yè)、環(huán)保、海洋生物/水產(chǎn)品、制藥、農(nóng)業(yè)微生物、生物治理、化妝品、臨床等領(lǐng)域的微生物鑒定試驗中，可鑒定包括革蘭氏陰性菌、革蘭氏陽性菌、厭氧菌、酵母、絲狀真菌在內(nèi)的近2000種微生物。
（3）分子生物學(xué)鑒定
應(yīng)用分子生物學(xué)方法從遺傳進(jìn)化角度闡明微生物種群之間的分類學(xué)關(guān)系是目前微生物分類學(xué)研究普遍采用的鑒定方法。GIMCC擁有應(yīng)用于微生物菌種分類鑒定的分子生物學(xué)實驗室，配置有PCR儀、高速冷凍離心機(jī)、電泳儀、凝膠成像儀等先進(jìn)設(shè)備，以及DNAMAN、BIOEDIT、CLUSTALX、TREEVIEW等系列序列分析軟件。目前GIMCC可采用核酸序列分析法分析細(xì)菌16S rDNA/16S-23S rDNA區(qū)間序列、酵母18S rDNA和26S rDNA D1/D2序列及絲狀真菌的18S rDNA和ITS1-5.8S-ITS2序列，構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹，提供科學(xué)的鑒定結(jié)果。
（4）API自動鑒定（生化指標(biāo)）